מרדכי זעירא כתב מנגינות לטובי המשוררים, ובהם נתן אלתרמן, יעקב אורלנד ואלכסנדר פן. בשיריו מיזוג של מזרח ומערב, נימה של זמר חסידי והשפעות של הלחן הרוסי. בין שיריו הידועים: "שלכת" ("עמוק העצב בעיניים"), "חולצה כחולה", "לילה לילה" ו"היו לילות".